katalizują z udziałem koenzymów odwracalne wielosubstatatowe reakcje utleniania i redukcji. Większość reakcji katalizowanych przez enzymy należące do tej klasy można zapisać wzorem
katalizują odwracalnie wielosubstatatowe reakcje przeniesienia grup funkcyjnych z donora na akceptor, zwykle z udziałem specyficznych koenzymów. Typowymi przedstawicielami są aminotransferazy, fosfotransferazy (kinazy), acylotransferazy,
katalizują jednosubstratowe reakcje polegające na rozszczepiania wiązania bez przyłączenia cząsteczki wody, reakcjom katalizowanym przez liazy towarzyszy powstanie wiązania podwójnego, niektóre reakcje są odwracalne np -C-C- (dekarboksylazy)
katalizują odwracalną izomeryzację cząsteczek substratów typu racemizacja, epimeryzacja, izomeryzacja cist-trans, wewnątrz cząsteczkowe reakcje oksydoredukcyjne i przeniesienia grup. Są to reakcje jednosubstratowe