aminokwasy

co to aminokwasy

aminokwasy to związki organiczne o niewielkich cząsteczkach. W komórkach mogą występować w stanie wolnym lub łączyć się ze soba tworząc związki o charakterze polimerów (Peptydy i białka)

Z jakich pierwiastków są zbudowane aminokwasy

węgiel wodór tlen i azot. czasem Siarka a wyjątkowo inne pierwiastki chemiczne

Z jakich grup funkcyjnych są zbudowane aminokwasy

I kwasowej grupy karboksylowej (-COOH) i oraz zasadowej grupy aminowej (–NH2)

aminokwasy białkowe

W odpowiednich warunkach mogą się ze soba łączyć tworząc Peptydy lub białka (do tej grupy należy 20 aminokwasów)

aminokwasy niebiałkowe

nie wchodzą w skład Białek do tej grupy należą pozostałe aminokwasy

jaką funkcję pełnią aminokwasy niebiałkowe

np. kwas gamma-aminomalsowy przekazuje informacje o ukladzie nerwowym

od czego najczęściej pochodzą nazwy zwiczajowe aminokwasów

od nazwy materiału biologicznego z którego zostały wy izolowane po raz pierwszy

Wspólna cecha budowy aminokwasów białkowych

grupa aminowa połączone z atomem węgla który znajduje się bezpośrednio przy grupie karboksylowej (atom wegla alfa) w ten sosib zbudowane aminokwasy nazywaja sie alfa-aminokwasami

co jest połączone z atomem węgla Alfa

Atom wodoru oraz łańcuch boczny (R)

co to łańcuch boczny

może być to pojedynczy atom wodoru, łańcuch lub pierścień

jakie dodatkowe grupy funkcyjne mogą znajdować się w obrębie łańcucha bocznego

między innymi grupa karboksylowa aminowa hydroksylowa (–OH) Lub tilowa (–SH)

jaki charakter nadają grupy funkcyjne aminokwasów są

Kwasowo – zasadowy

jak tworzą się jony

przez oddania przez grupę karboksylową protonu (H +) lub przyjęcie protonu przez grupę aminową

jony obojnacze

Obie grupy są zjonizowane

kationy

grupa aminowa jest zjonizowana

aniony

grupa karboksylowa jest zjonizowana

punkt izoelektryczny

wartość ph środowiska w której aminokwas występuje głównie w postaci jonu obojnaczego

odzcyn cytozolu komorki i plynie ustorjowych

mają Odczyn zbliżony do obojętnego dlatego większość wolnych aminokwasów występuje w nich formie jonów obojnaczych

funkcja jonów obojnaczych

funkcja buforujaca- utrzymuja wzglednie stale ph srodowiska wewnętrznego

zakwaszanie ph

jony obojnacze przechodza w kationy

alkalizacja

jony obojnacze pzrechodza w aniony

aminokwasy obojętne

mają jedną grupę karboksylową i jedną grupę aminową należy do nich większość aminokwasów białkowych

aminokwasy kwasowe

mają dodatkową grupę karboksylową zlokalizowane w obrębie łańcucha bocznego

aminokwasy zasadowe

mają dodatkową grupę aminową (lub kilka grup aminowych) zlokalizowana w obrębie łańcucha bocznego

czy struktura łańcucha bocznego ma wpływ na rozpuszczalność tej innego aminokwasu w wodzie

tak

aminokwasy rozpuszczalne w wodzie

aminokwasy hydrofilowe

aminokwasy nierozpuszczalne w wodzie

aminokwasy hydrofobowe

aminokwasy hydrofobowe

charakteryzują się zwykle węglowodorowy mi łańcuchami bocznymi nierozpuszczalne w wodzie są także Tryptofan i metationina

wiązania peptydowe

wiązania tworzące się między grupą karboksylową połączoną z atomem węgla Alfa jednego aminokwasu a grupą aminową połączoną z atomem węgla Alfa drugiego aminokwasu

polarny łańcuch peptydowy

efekt Wiązania peptydowego na jednym koncie (N) znajduje się wolna grupa aminowa a na drugim końcu (C) wolna grupa karboksylowa

sekwencje aminokwasowe łańcucha peptydowego zapisuje się

od N – końca do C – końca

zawartość aminokwasów w peptydzie

od 2 do 50

zawartości amjnokwasow w białkach (polipetdydach)

ponad 50

synteza łańcucha peptydowego

reakcja kondensacji podczas której powstają również cząsteczki wody

struktura pierwszorzędowa białka

to liczba rodzaj i kolejność aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym utrzymują ją Wiązania peptydowe między sąsiadującymi aminokwasami

struktura III-rzedowa

to przestrzenne pofaldowanie calego lancucha polipeptydowego o strukturze 2 rzedowej

struktura IV-rzedowa

to wzajemne ułożenie osobnych Łańcuchów polipeptydowych o strukturze trzeciorzędowej

podział ze względu na kształt cząsteczki białka

białka fibrylarne i białka globularne

bialka fibrylarne

np. collagen składają się zwykle z kilku Łańcuchów polipeptydowych połączonych długie włókna nie rozpuszczają się one w wodzie cechują się także znaczną wytrzymałośćcią mechaniczną z tego powodu pełnią najczęściej funkcję budulcowym lub ochroną

bialka globularne

np. histo ny mają kształt zbliżony do kuli z tego większość z nich dobrze rozpuszcza się w wodzie i swobodnie przemieszcza się w obrębie komórek oraz płynów ustrojowych białka globu ralny pełnią najczęściej funkcję metaboliczne lub fizjologiczne bo

podział Białek ze względu na skład chemiczny

białka proste i złożone

białka proste

np. Albumina osocza krwi są zbudowane wyłącznie z aminokwasów

białka złożone

są zbudowane z aminokwasów i grup zawierających między innymi jony metali np. żelazo Ferrytyna małe cząsteczki związków nieorganicznych lub np. ham w hemoglobinie lub cząsteczki związków organicznych np. cukier

struktura drugorzędowa

odcinki łańcucha polipeptydowego są z sfałdowane przestrzennie w A – Helisa lub Beta – Helisa strukturę te utrzymują Wiązania wodorowe które tworzą się między grupami N H A grupami CO wchodzącymi w skład wiązań peptydowych

dwa rodzaje koagulacji Białek

wysalanie i Denaturacja

wysalanie białka

zachodzi pod wpływem soli metali lekkich np. N A CL skutkuje powstaniem osadu jest odwracalne po dodaniu wody ponownie w przechodzi w Koloid (Peptyzacja)

denaturacja bialka

zachodzi pod wpływem czynników fizycznych (wysoka temperatura) lub chemicznych (stężonych kwasów zasad alkoholi lub soli metali ciężkich)

nukleotydy

związki organiczne o niewielkich cząsteczkach w komórkach mogą występować w stanie wolnym lub łączy się z tobą tworzyć dinukleotydy oraz Polinukleotydy-kwasy nukleinowe

pierwiastki budujące Nukleotydy

węgiel wodór tlen azot Fosfor

elementy nukleotydu

1. pięciowęglowy cukier (pętoza) – ryboza lub deoksyryboza 2. jedna z pięciu zasad azotowych 3. od jednej do trzech reszt Fosforowych (V)

zasady Azotowe

guanina (G) adenina (A) Cytozyna (C) Tymina (T) lub Uracyl (U)

Z czym łączy się pięcio Węglowy cukier i jak nazywa się to wiązanie

Łączy się z zasadą Azotową wiązaniem N – glikozydowym w wyniku czego pwostaje nukleozyd

Z czym łączy się Nukleozyd

Z resztą fosforanową (V) wiązaniem astrowe tworząc nukleotyd

podział nukleotydów

Rybonukleotydy i deoksyrybonukleotydy

Rybonukleotydy

zawierają rybozy i jedną z czterech zasad azotowych Guanina adenina ninę Cytozyna lub Uracyl oznacza się je za pomocą trzyliterowym skrótów np. Adenozynotrifosforan – atp

droksyrybonukleotydy

zawierają dał z rybozy oraz jedną z czterech zasad azotowych G A C T

dinukleotydy

związki zbudowane z dwóch połączonych ze soba nukleotydów pełnią funkcje przenośników elektronów w procesach metabolicznych

DNA i RNA

są to Polinukleotydy (polimery) zbudowany z wielu nukleotydów (monimerów)