BIOLOGIA MOLEKULARNA 2

 0    171 fiszek    chomikmimi
ściągnij mp3 drukuj graj sprawdź się
 
Pytanie język polski Odpowiedź język polski
Białka, światło?
rozpocznij naukę
Światło o długośi 280 nm
Absorpcja gdzie najwieksza
rozpocznij naukę
dla nukleotydów
Absorpcja gdzie najmniejsza
rozpocznij naukę
dla dsDNA
Od czego zależy współczynnik ekstyncji'?
rozpocznij naukę
Od długości badanej cząsteczki
co znaczy hipochromizm
rozpocznij naukę
mniej barwny
dsDNA o stęż 1mg/ml ile a?
rozpocznij naukę
a260 = 20
RNA i ssDNA ile a?
rozpocznij naukę
a260- 25
co ma wyższy współczynnik ekstynkcji, puryny czy pirymidyny?
rozpocznij naukę
puryny
Topnienie (ogrzewanie) - absorbancja?
rozpocznij naukę
40% wzrost absorbancji
Szybkie ochładzanie - absorbancja?
rozpocznij naukę
Minimalny spadek absorbancji
Wolne ochładzanie - absorbancja?
rozpocznij naukę
Absorbancja bez zmian
Wektor, jaka zdolność
rozpocznij naukę
Zdolność do izolacji od gospodara i replikacji
Fag alfa, zdolność?
rozpocznij naukę
Zdolność do klonowania większych fragmentów
h13 zdolność?
rozpocznij naukę
zdolność do klonowanie fragmentów jednoniciowych
co to kosmid?
rozpocznij naukę
plazmid + fag alfa
Episomalne plazmidy są wektorami dla?
rozpocznij naukę
Są wektorami dla drożdzy
Plazmid Ti wektor dla?
rozpocznij naukę
Roślin
Biblioteki DNA
rozpocznij naukę
zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne
rozpocznij naukę
analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne
rozpocznij naukę
są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+, Rb2+
Transformanty, gdzie najpierw są przechowywane?
rozpocznij naukę
w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja)
Gdzie po selekcji są przechowywane transformanty?
rozpocznij naukę
Są zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy), tzw. zapas glicerolowy
Co robi fosfotaza alkaliczna?
rozpocznij naukę
ten enzym usuwa reszty fosforanowe z 5'
co robi polimeraza DNA I?
rozpocznij naukę
ten enzym odpowiada za syntezez nici z 5->3
co to Fragment klenowa?
rozpocznij naukę
ten enzym to pochodna polimerazy DNA I, brak własciowsci egzonukleazy
Nukleaza fasoli mung co to
rozpocznij naukę
ten enzym trawi jednoniciowe fragmenty naprzeciw pęknięcia nici
ODWROTNA TRANSKRYPTAZA
rozpocznij naukę
Zależna od RNA, synteza DNA komplementarnego do RNA w kierunku 3->5 od startera z 3'OH
czego wymaga odwrotna transkryptaza?
rozpocznij naukę
trifosforanów deoksyrybonukelozydów
co robi RNAza A?
rozpocznij naukę
ten enzym trawi RNA
co robi RNAza H?
rozpocznij naukę
ten enzym trawi RNA hybrydy DNA-RNA
Terminalna transferaza co robi
rozpocznij naukę
ten eznym dodaje nukleotydy do końca 3' a jak GTP to powtaje ogon oligoG
A260/a280 = 1,8 a czystość dna
rozpocznij naukę
Czyste DNA
a260/280 < 1,8 a czystosc DNA
rozpocznij naukę
zanieszczone białkiem
a260/280 > 1,8 a czystosc DNA
rozpocznij naukę
zanieszczyczone RNA
co to Wirowanie izopikniczne
rozpocznij naukę
równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia wirowanie izopikniczne?
rozpocznij naukę
Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Gęstość DNA w wirowaniu izopiknicznym?
rozpocznij naukę
1,7g/cm3
Co robi RNA i białka w wirowaniu izopiknicznym?
rozpocznij naukę
RNA w dół, białka flotują(unoszą się)
Jaki barwnik w elektroforezie?
rozpocznij naukę
różowo/pomarańczowy bromek etydyyny
jak zachodzi elektroforeza
rozpocznij naukę
od KATODY (-) do ANODY (+)
Od czego zależy szybkość migracji kolistego DNA w elektroforezie?
rozpocznij naukę
od warunków
Napięcie w elektroforezie
rozpocznij naukę
5-8 V/cm3
Gdzie najlepiej widoczna elektroforeza?
rozpocznij naukę
w RNA
Jakie środowisko zachodzenia elektroforezy?
rozpocznij naukę
W żelu agarozowym (bromek etydyny) lub poliakrydynowym (AgNO3/SYBR)
co to metoda gRTPCR?
rozpocznij naukę
real time, analiza ilości produktów w czasie rzeczywistym
czego używa się w gRTPCR?
rozpocznij naukę
SYBR
cechy SYBR
rozpocznij naukę
nietoksyczny i silnie wiążacy DNA
Kiedy zachodzi analiza w gRTPCR?
rozpocznij naukę
analiza w czasie trawienia
czego analiza w gRTPCR?
rozpocznij naukę
Analiza polimorfizmu pojedynczych nukleotydów
Co jest znakowane w gRTPCR?
rozpocznij naukę
nukleotydy i sondy
Elektroforeza mikrokapilarna
rozpocznij naukę
z wykorzystaniem macierzy
Elektroforeza kapilarna
rozpocznij naukę
w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, z cienkiej kapilarze kwarcowej
W żelu poliakrydynowym elektoforeza (PZ)
rozpocznij naukę
5-1000 pz (gRTPCR)
w żelu agarozowym elektroforeza
rozpocznij naukę
0,1 - 20 kpz
w polu pulsacyjnym elektroforeza
rozpocznij naukę
20kpz - 10 Mpz, oddziela cząsteczki wielkości 100kpz
Choroba takahary, inna nazwa
rozpocznij naukę
alaktazemia
jaki gen, choroba Takahary?
rozpocznij naukę
Gen kontrolujący syntezę katalazy, krótkie ramie chromosomu 11 (11p13)
jak dziedziczona alaktazemia?
rozpocznij naukę
autosomalnie recesywnie
Na czym polega alaktazemia?
rozpocznij naukę
Redukcja aktywnośći katalazy
gdzie najczęściej alaktazemia?
rozpocznij naukę
Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Objawy alaktazemii
rozpocznij naukę
Owrzodzenie śluzówek jamy ustnej, podudzi, oraz wczesne wypadanie zębów
Cholinoesteraza
rozpocznij naukę
gen na 3 chromosomie i tam mutacja
Wrażliwość na chlorek suksametonium, objawy?
rozpocznij naukę
zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale też szybko zanika. (za objawy odpowiada hydroliza sukcynylocholiny)
za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialna jest?
rozpocznij naukę
cholinoesteraza
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
rozpocznij naukę
autosomalnie dominująco
Przez co wywoływana hipertermia złośliwa
rozpocznij naukę
leki znieczulenia ogólnego: antystetyki wziewne, dożylne, leki zwiotczające, glikozydy naprastnicy
Objawy hipertemia złośliwa
rozpocznij naukę
wzrasta napięcie mięsni prązkowanych, drzenie mięsniowe, pojawa się tachykardia i wzrost temperatury ciała(1 stopien w ciagu 5 min)
Mutacja genu 19q13.1
rozpocznij naukę
Koduje receptor rianodynowy uwalniajacy wapń z retikulum do cytoplazmy ->hipertermia złośliwa
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
rozpocznij naukę
autosomalnie dominująco
Alaktazemia jaki gen
rozpocznij naukę
11p13
jak dziedziczona alaktazemia?
rozpocznij naukę
autosomalna recesywna
Metaboizm alkoholu etylowego, jakie enzymy?
rozpocznij naukę
Dehydrogenaza alkoholowa ADH i dehydrogenaza aldehydowa ALDH
gdzie dehydrogenaza alkoholowa ADH?
rozpocznij naukę
chromosom 4
gdzie dehydrogenaza aldehydowa ALDH?
rozpocznij naukę
1-chromosom 9, 2-chromosom 12
Porifiryny
rozpocznij naukę
prekursory hemu i składniki enzymów
na jakie dzielimy porifiryny
rozpocznij naukę
na wątrobowe i erytropoetyczne
Porfirie, na czym polega
rozpocznij naukę
Deficyt enzymów biorących udział w przemianach porfiryn
Jak dziedziczone porfirie?
rozpocznij naukę
Autosomalnie dominująco
Krzywica odporna na wit D3, jaki gen?
rozpocznij naukę
gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowej, jaki chromosom
rozpocznij naukę
chromosom X
niedobór alfa-1-antytrypsyny, jaki gen i chromosom
rozpocznij naukę
Gen PI, chromosom 14
niedobór paraoksonazy, gen + chromosm
rozpocznij naukę
gen PON1 na chromosomie 7 sprzeżony z genem CFTR
Hemochromatoza, jaki gen
rozpocznij naukę
gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
hipolaktazja, jaki gen
rozpocznij naukę
3 allele na chromosomie 3
fenyloketonuria, jaki gen
rozpocznij naukę
12q24.1
Jak dziedziczona fenyloketonuria?
rozpocznij naukę
autosomalnie recesywnie
Co wywołuje ostrą porfirie?
rozpocznij naukę
Lek, infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizycnzy
Jakie leki wywołują ostrą porfifrie?
rozpocznij naukę
barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanolu,
Kiedy forma enolowa?
rozpocznij naukę
w pH zasadowym
Kiedy forma ketonowa?
rozpocznij naukę
w ph obojętnym
Co to sonikacja?
rozpocznij naukę
Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA
Do czego prowadzi sonikacja?
rozpocznij naukę
Do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkośći
Podział zasad
rozpocznij naukę
Puryny i pirymidyny
Puryny
rozpocznij naukę
adenina i guanina (2 pierścienie)
Pirymidyny
rozpocznij naukę
cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścien)
Co to liza alkaliczna?
rozpocznij naukę
Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosowego DNA i innych
Plazmidy
rozpocznij naukę
Autonomiczne, pozachromosome elementy genetyczne
W jakiej postaci występują Plazmidy?
rozpocznij naukę
w postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
gdzie wystąpują Plazmidy?
rozpocznij naukę
u prokariotów i niektórych eukariotów
Jaka zdolnosc maja plazmidy?
rozpocznij naukę
Zdolność do trwałego utrzymywania się i replikowania w komórce
Plazmidy a chromosomy gospodarza
rozpocznij naukę
Są odrębne od chromosomów gospodrza
Jaką struktuę tworzą plazmidy?
rozpocznij naukę
CCC-DNA
co robi CCC-DNA?
rozpocznij naukę
wykazuje negatywne superskręcenie
Jakie plazmidy nie tworzą struktury CCC-DNA?
rozpocznij naukę
Plazmidy izolowane z hypertermofilnych Archaea, u których jest pozytywne superskręcenie cz. DNA
wielkość plazmidów
rozpocznij naukę
od 1000 pz do 1,7 Mpz
Gdzie najmniejsze plazmidy?
rozpocznij naukę
U Heamophilus somnus, Mycoplasma i Helicobacter pylori
Gdzie największe plazmidy?
rozpocznij naukę
u Rhizobium
Gen kodujący białko (plazmidy)
rozpocznij naukę
30 kDa - 1 kpzC
Co zawierają plazmidy?
rozpocznij naukę
Region początku replikacji
Jakie geny często zawierają plazmidy?
rozpocznij naukę
odporności, np. gen bla / ampr
Co robi gen bla/ampr?
rozpocznij naukę
Koduje beta-laktamaze, która rozkłada antybiotyki penicylowe
NORTHERN BLOT
rozpocznij naukę
dla transferu rozdzielonego elektroforetycznie DNA
SOUTHERNBLOT
rozpocznij naukę
osmoza do wymuszenia węrdrówki soli z pociąganiem DNA ze sobą
WESTERN BLOT
rozpocznij naukę
dla transferu białka
EASTERN BLOT
rozpocznij naukę
dla transferu białek po ich rozdziale w elektroforezie dwukierunkowej
DNA/RNA w środowisku kwasowym
rozpocznij naukę
hydroliza
DNA/RNA w środowisku lżej kwasowym (3-4)
rozpocznij naukę
hydroliza wiązan glikozydowych, kwas apurynowy
DNA/RNA w środowisku zasadowym
rozpocznij naukę
denaturacja (RNA i DNA), hydroliza (RNA, bo ma 2-OH')
Co jest bardziej podatne na hydrolize? DNA czy RNA?
rozpocznij naukę
ZAWSZE RNA
Multipleks PCR
rozpocznij naukę
ampliflikacja równoczesna
Nested-PCR
rozpocznij naukę
wewnętrzna/gniazdowa, gdy mało matryc
RT-PCR
rozpocznij naukę
przepisanie sekwencji z MRNA składającego się z samych eksonów na cDNA - stwierdzanie obecności określonych transkryptów
STS-PCR
rozpocznij naukę
Umożliwia indentyfikację poszczególnych loci dzięki amplifikacji fragmentu DNA pomiędzy parą starterów o znanej sekwencji
STS – ile pz?
rozpocznij naukę
200-300 pz
Zagęszczanie map genetycznych, jaka metoda
rozpocznij naukę
STS-PCR
Poszukiwanie sprzężen z cechami genotypowymi, jaka metoda
rozpocznij naukę
STS-PCR
do uporządkowania bibiloteki genomowej w KONTIGI, jaka metoda?
rozpocznij naukę
STS-PCR
RACE-PCR
rozpocznij naukę
szybka amplifikacja końców Cdna, poznanie dokładnej sekwencji jednego z końców
ASA=PASA=ASP=ARMS
rozpocznij naukę
amplifikacja alleo-specyficzna, wykrywa polimorfizm alleli i mutacji punktowych
ASO
rozpocznij naukę
połączenie hybrydyzacji i PCR
co robi sonda w ASO?
rozpocznij naukę
sonda rozponzacje allel prawidłowy/zmutowany
OLA
rozpocznij naukę
badanie ligacji oligonukleotydów, połączenie PCR i ligacji DNA
REP-PCR
rozpocznij naukę
wykorzystanie sekwencji repetytywnych
AS-PCR
rozpocznij naukę
asymetryczne PCR, amplifikowana tylko 1 nić, na 3' fluorochrom
I-PCR
rozpocznij naukę
odwrócona PCR, DNA oskrzydla znana sekwencje
PCR in situ
rozpocznij naukę
z udziałem znakowanych nukleotydów, czuła i kosztowna
RAPD-PCR
rozpocznij naukę
losowa amplifikacja polimorficznego DNA, umożliwia jednoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
Jaka ilość DNA wyjściowego w RAPD-PCr?
rozpocznij naukę
mała
W jakiej metodzie PCR wykyrywane loci mają dominujący charakter?
rozpocznij naukę
w RAPD-PCR
W jakiej metodzie nie można odróżnić homozygot od heterozygot?
rozpocznij naukę
w RAPD-PCR, bo wizualizacja tylko jednego z dwóch alleli
Badanie jakiego materiału jest zalecane przy RAPD-PCR?
rozpocznij naukę
Haploidalnego materiału
W jakiej metodzie badanie zróżnicowania DNA jądrowego między osobnikami i populacjami?
rozpocznij naukę
RAPD-PCR
Jaka metoda umożliwia szybkie określenie liczby chromatyny X i Y w jądrach interfazowych?
rozpocznij naukę
FISH
FISH umożliwia zlokalizowanie jakich sekwencji DNA?
rozpocznij naukę
nieswoistych sekwencji DNA bezporśrednio w materiale genetycznym
Jakie zmiany bada FISH?
rozpocznij naukę
Zmiany ilościowe w liczbie i strukturze chromosomów
Metoda oparta na fish
rozpocznij naukę
cytogenetyka interfazalna
Do czego hybrydyzacja typu northern?
rozpocznij naukę
do analizy RNA i procesu transkrypcji poszczególnych genów
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji w badanych tkankach - jaka metoda
rozpocznij naukę
Hybrydyzacja typu northern
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji na danym etapie rozwoju - jaka metoda?
rozpocznij naukę
hybrydyzacja typu northern
Poznanie czego jest możliwe dzięki hybrydzacji typu northern?
rozpocznij naukę
Poznanie długości RNA i intensywność jego transkrybcji
Hybrydyzacja RNA-DNA jaka metoda
rozpocznij naukę
northern
Hybrydyzacja DNA-DNA jaka metoda
rozpocznij naukę
southern
HGP
rozpocznij naukę
projekt poznania ludzkiego genomu
knockout
rozpocznij naukę
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego typu
genomika porównawcza
rozpocznij naukę
porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika
rozpocznij naukę
wiedza o zespolach bialek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika
rozpocznij naukę
badanie regulacji ekspresji genów na poziome transkrypcji
gdzie znalezione enzymy restrykcyjne?
rozpocznij naukę
jedynie w komórkach bakterii i sinic
Enzym restrykcyjny jakie sekwencje rozpoznaje?
rozpocznij naukę
Speficzyne sekwencje dwuniciowego DNA o długości 4-8 par zasad
Aktywność STAR
rozpocznij naukę
niespecyficznośćenzymów restrykcyjnych w niektórych warunkach
kiedy aktywność star?
rozpocznij naukę
kiedy trawienie przeprowadza sięwinnych warunkach niż optymalnie
Enzym EcoRI a zmienione warunki
rozpocznij naukę
zmienione warunki mogę uniemożliwić wykrycie struktury GAATTC, którą normalnie rozpoznaje
co to optymalne warunki trawienia
rozpocznij naukę
odpowiednie Ph, stęzenie jonów magnezu
Co pozostawiją enzymy restrykcyjne?
rozpocznij naukę
Końce tępe i lepkie w cząsteczce
Gdy obie nici rozcięte są naprzeciwko siebie równolegle, powstają
rozpocznij naukę
tępe końce
Gdy jednoniciowe sekwencje wystepujace na obu koncach sa przeciete niesymetrycznie, powstaja
rozpocznij naukę
lepkie konce
Restryktazy czworkowe
rozpocznij naukę
rozpoznaja sekwencje DNA co 256pz
Restryktazy szostkowe
rozpocznij naukę
Rozpoznaja sekwencje DNA co 4096 pz
Izoschizomery
rozpocznij naukę
enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Egzonukleazy
rozpocznij naukę
umożliwiaja odpowiednią modyfikacje koncow we fragmentach DNA
polimerazy
rozpocznij naukę
odpowiedzialne za amplifikację odpowiednich odcinkow DNA

Musisz się zalogować, by móc napisać komentarz.